Links Synbio

Recursos Online

OpenWetWare: Promove o compartilhamento de informações científicas entre pesquisadores e grupos que trabalham no campo da biologia e da engenharia genética. Excelente para encontrar protocolos e grupos de discussões.

 

 

The Leukippos Institute: Um “Instituto na Nuvem” com tudo o que tem direito, com vários recursos de compartilhamento de informações científicas, blog, discussões, grupos de pesquisa, tudo envolvendo biologia sintética. Ótimo para encontrar informações relevantes sobre papers e se inteirar das últimas notícias no mundo do Synbio.

 

Bionumbers: Um ótimo banco de dados numéricos biológicos (para mais informações, veja este post do blog).

mFold: Software muito popular para calcular o dobramento de RNA.

 

ACGT melting calculator: Calcula a quantidade de ACGT e temperatura de anelamento de primers.

 

Oligocalc: Propriedades de RNA e DNA.

 

BioMath Calculators:Conversor de unidades.

 

 

E. coli Statistics: Informações úteis de E.coli.

 

 

 

Cold Springs Harbor Protocols: Revistas de protocolos de laboratório.

 

 

BLAST: Basic Local Alignment Search Tool: Análise de sequências de DNA e aminoácidos.

 

ClustalW: Alinhamento de sequências.

 

 

Protein Calculator: Propriedades de proteínas.

Softwares: Livres e Amigáveis

FastPCR: Ótimo para desenho de primers, PCR in silico e encontrar enzimas de restrição em uma sequência.

 

 

GeneDesigner 2.0: Imprescindível para construção de genes sintéticos.

 

MEGA: Softwares para realizar alinhamentos de sequências e construir árvores filogenéticas. Dica para usar: não coloque espaço entre o nome das sequências.

Bioedit: Para verificar a qualidade de sequenciamento de DNA e editar sequências.

 

Computational Tools for Synbio: Uma lista de programas relacionados com biologia sintética: CADs, simulators, databases, lab managements systems, automation software, etc…

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